Los factores que influyen en la reacción enzimática, son los mismos que influyen sobre cualquier proteína, factores que influyen negativamente son la temperatura, a altas temperaturas las proteínas se desnaturalizan, y por lo tanto la enzima pierde su función, normalmente las enzimas tienen una temperatura estándar donde funcionan a la velocidad adecuada.
El PH puede ser tanto una modificación positiva, como es el caso de la pepsina, que se activa a PH Por debajo de 2, mientras que la amilasa salival, se inactiva a ese PH, siendo negativa para la enzima.
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